И сказал Бог...

[grihan]

Не так давно с помощью молекулярной динамики было впервые на компьютере "посчитано" живое существо - вирус. То есть была построена модель, и запущена программа, показывающая как вирус себя ведёт - то есть живёт (!) - в капельке солёной воды.

Ранее было проделанно гораздо более внушительное исследование: был моделирован синтез белка "молекулярным заводом" - рибозомом. То есть опять - построили модель, запустили программу - и всё заеблось оно "ожило" - компьютерный рибозом начал синтезировать компьютерный белок из компьютерных аминокислот с помощью компьютерных т-РНК в компьютерной воде. Чтоб зафиксировать 2 наносекунды работы рибозома потребовалось совокупная вычислительная мощность 768 микропроцессоров, работавших в течение 260 дней.

А теперь предположим, что компьютерные мощности вырастут на несколько порядков. Это значит, что можно будет "посчитать" сначала целую бактерию, всю её жизнь, питание, размножение, атаку вирусом, взаимодействие с антибиотиками. Потом можно будет проделать тоже с многоклеточным существом, а потом... "и сотворил бог Адама"!!

Под катом два ролика в которых с помощью молекулярной динамики моделировали замерзание воды и растворение соли:

Comments

[grihanm.livejournal.com]

Я просто не понял Ваш комментарий. 2 наносекунды - достаточный срок, чтобы увидеть как именно 2 аминокислоты сочетаются и какова роль каждой части рибозома и т-РНК в этом процессе. О чём сопсна и пишут в PNASe.

[grihanm.livejournal.com]

В данном случае мы имеем дело с симуляцией реального процесса - то есть вот он. Это proof of concept. А их главная находка - "прежде неизвестный механизм отбора аминокислот, подходящих для синтеза белка" - позже была вполне подтверждена эксперементально.

[grihanm.livejournal.com]

Всё чистая правда: "компьютерный рибозом начал синтезировать
компьютерный белок из компьютерных аминокислот
с помощью компьютерных т-РНК в компьютерной воде."

[grihanm.livejournal.com]

Я смотрел. Вам - явно не помогло. :)

[grihanm.livejournal.com]

Докинг т-РНK в рибозому - это одна из наиболее важных стадий синтеза белка.